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浅谈Python描述数据结构之KMP篇

今天带来浅谈Python描述数据结构之KMP篇教程详解

前言

  本篇章主要介绍串的KMP模式匹配算法及其改进,并用Python实现KMP算法。

1. BF算法

  BF算法,即 B r u c e − F o r c eBruce-ForceBruce−Force算法,又称暴力匹配算法。其思想就是将主串S的第一个字符与模式串T的第一个字符进行匹配,若相等,则继续比较S的第二个字符和T的第二个字符;若不相等,则比较S的第二个字符和T的第一个字符,依次比较下去,直到得出最后的匹配结果。

  假设主串 S = A B A C A B A BS=ABACABABS=ABACABAB,模式串 T = A B A BT=ABABT=ABAB,每趟匹配失败后,主串S指针回溯,模式串指针回到头部,然后再次匹配,过程如下:

def BF(substrS, substrT):   if len(substrT) > len(substrS):     return -1   j = 0   t = 0   while j < len(substrS) and t < len(substrT):     if substrT[t] == substrS[j]:       j += 1       t += 1     else:       j = j - t + 1       t = 0   if t == len(substrT):     return j - t   else:     return -1

2. KMP算法

  KMP算法,是由 D . E . K n u t h 、 J . H . M o r r i s 、 V . R . P r a t tD.E.Knuth、J.H.Morris、V.R.PrattD.E.Knuth、J.H.Morris、V.R.Pratt同时发现的,又被称为克努特-莫里斯-普拉特算法。该算法的基本思路就是在匹配失败后,无需回到主串和模式串最近一次开始比较的位置,而是在不改变主串已经匹配到的位置的前提下,根据已经匹配的部分字符,从模式串的某一位置开始继续进行串的模式匹配。

  就是这次匹配失败时,下次匹配时模式串应该从哪一位开始比较。

  BF算法思路简单,便于理解,但是在执行时效率太低。在上述的匹配过程中,第一次匹配时已经匹配的 " A B A ""ABA""ABA",其前缀与后缀都是 " A ""A""A",这个时候我们就不需要执行第二次匹配了,因为第一次就已经匹配过了,所以可以跳过第二次匹配,直接进行第三次匹配,即前缀位置移到后缀位置,主串指针无需回溯,并继续从该位开始比较。

  前缀:是指除最后一个字符外,字符串的所有头部子串。   后缀:是指除第一个字符外,字符串的所有尾部子串。   部分匹配值 ( P a r t i a l(Partial(Partial M a t c h , P M )Match,PM)Match,PM):字符串的前缀和后缀的最长相等前后缀长度。   例如, ′ a ′'a'′a′的前缀和后缀都为空集,则最长公共前后缀长度为0; ′ a b ′'ab'′ab′的前缀为 { a }\{a\}{a},后缀为 { b }\{b\}{b},则最长公共前后缀为空集,其长度长度为0; ′ a b a ′'aba'′aba′的前缀为 { a , a b }\{a,ab\}{a,ab},后缀为 { a , b a }\{a,ba\}{a,ba},则最长公共前后缀为 { a }\{a\}{a},其长度长度为1; ′ a b a b ′'abab'′abab′的前缀为 { a , a b , a b a }\{a,ab,aba\}{a,ab,aba},后缀为 { b , a b , b a b }\{b,ab,bab\}{b,ab,bab},则最长公共前后缀为 { a b }\{ab\}{ab},其长度长度为2。   前缀一定包含第一个字符,后缀一定包含最后一个字符。

 如果模式串1号位与主串当前位(箭头所指的位置)不匹配,将模式串1号位与主串的下一位进行比较。 next[0]=-1 ,这边就是一个特殊位置了,即如果主串与模式串的第1位不相同,那么下次就直接比较各第2位的字符。

 如果模式串2号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A ""A""A",即最长公共前后缀为空集,其长度为0,则下次匹配时将模式串1号位与主串的当前位进行比较。 next[1]=0

  如果模式串3号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B ""AB""AB",即最长公共前后缀为空集,其长度为0,则下次匹配时将模式串1号位与主串的当前位进行比较。 next[2]=0

 如果模式串4号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B A ""ABA""ABA",即最长公共前后缀为 " A ""A""A",其长度为1,则下次匹配时将前缀位置移到后缀位置,即模式串2号位与主串的当前位进行比较。 next[3]=1

  如果模式串5号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B A A ""ABAA""ABAA",即最长公共前后缀为 " A ""A""A",其长度为1,则下次匹配时将前缀位置移到后缀位置,即模式串2号位与主串的当前位进行比较。 next[4]=1

  如果模式串6号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B A A B ""ABAAB""ABAAB",即最长公共前后缀为 " A B ""AB""AB",其长度为2,则下次匹配时将前缀位置移到后缀位置,即模式串3号位与主串的当前位进行比较。 next[5]=2

  如果模式串7号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B A A B C ""ABAABC""ABAABC",即最长公共前后缀为空集,其长度为0,则下次匹配时将模式串1号位与主串的当前位进行比较。 next[6]=0

  

如果模式串8号位与主串当前位不匹配,找最长公共前后缀,指针前面的子串为 " A B A A B C A ""ABAABCA""ABAABCA",即最长公共前后缀为 " A ""A""A",其长度为1,则下次匹配时将模式串2号位与主串的当前位进行比较。 next[7]=1

  综上,可以得到模式串的 next 数组,发现没有,把主串去掉也可以得到这个数组,即下次匹配时模式串向后移动的位数与主串无关,仅与模式串本身有关。

位编号 1 2 3 4 5 6 7 8 索引 0 1 2 3 4 5 6 7 模式串 A B A A B C A C next -1 0 0 1 1 2 0 1

   next 数组,即存放的是每个字符匹配失败时,对应的下一次匹配时模式串开始匹配的位置。

  如何在代码里实现上述流程呢?举个栗子,蓝色方框圈出的就是公共前后缀,假设 next[j]=t :

 当 T j = T tT_j=T_tTj=Tt时,可以得到 n e x t [ j + 1 ] = t + 1 = n e x t [ j ] + 1next[j+1]=t+1=next[j]+1next[j+1]=t+1=next[j]+1。这个时候 j = 4 , t = 1j=4,t=1j=4,t=1(索引);

  当 T j ≠ T tT_j \neq T_tTj=Tt时,即模式串 ttt位置与主串(并不是真正的主串)不匹配,则将下面的那个模式串移动到 n e x t [ t ]next[t]next[t]位置进行比较,即 t = n e x t [ t ]t=next[t]t=next[t],直到 T j = T tT_j=T_tTj=Tt或 t = − 1t=-1t=−1,当 t = − 1t=-1t=−1时, n e x t [ j + 1 ] = 0next[j+1]=0next[j+1]=0。这里就是 t = n e x t [ 2 ] = 0t=next[2]=0t=next[2]=0,即下次匹配时,模式串的第1位与主串当前位进行比较。

  代码如下:

def getNext(substrT):   next_list = [-1 for i in range(len(substrT))]   j = 0   t = -1   while j < len(substrT) - 1:     if t == -1 or substrT[j] == substrT[t]:       j += 1       t += 1       # Tj=Tt, 则可以到的next[j+1]=t+1       next_list[j] = t     else:       # Tj!=Tt, 模式串T索引为t的字符与当前位进行匹配       t = next_list[t]   return next_list def KMP(substrS, substrT, next_list):   count = 0   j = 0   t = 0   while j < len(substrS) and t < len(substrT):     if substrS[j] == substrT[t] or t == -1:       # t == -1目的就是第一位匹配失败时       # 主串位置加1, 匹配串回到第一个位置(索引为0)       # 匹配成功, 主串和模式串指针都后移一位       j += 1       t += 1     else:       # 匹配失败, 模式串索引为t的字符与当前位进行比较       count += 1       t = next_list[t]   if t == len(substrT):     # 这里返回的是索引     return j - t, count+1   else:     return -1, count+1

3. KMP算法优化版

  上面定义的 next 数组在某些情况下还有些缺陷,发现没有,在第一个图中,我们还可以跳过第3次匹配,直接进行第4次匹配。为了更好地说明问题,我们以下面这种情况为例,来优化一下KMP算法。假设主串 S = A A A B A A A A BS=AAABAAAABS=AAABAAAAB,模式串 T = A A A A BT=AAAABT=AAAAB,按照KMP算法,匹配过程如下:

 可以看到第2、3、4次的匹配是多余的,因为我们在第一次匹配时,主串 SSS的4号位为模式串 TTT的4号位就已经比较了,且 T 3 ≠ S 3T_3 \neq S_3T3=S3,又因为模式串 TTT的4号位与其1、2、3号位的字符一样,即 T 3 = T 2 = T 1 = T 0 ≠ S 3T_3=T_2=T_1=T_0 \neq S_3T3=T2=T1=T0=S3,所以可以直接进入第5次匹配。

  那么,问题出在哪里???我们结合着 next 数组看一下:

位编号 1 2 3 4 5 索引 0 1 2 3 4 模式串 A A A A B next -1 0 1 2 3

  问题在于,当 T j ≠ S jT_j \neq S_jTj=Sj时,下次匹配的必然是 T n e x t [ j ]T_{next[j]}Tnext[j]与 S jS_jSj,如果这时 T n e x t [ j ] = T jT_{next[j]} = T_jTnext[j]=Tj,那么又相当于 T jT_jTj与 S jS_jSj进行比较,因为它们的字符一样,毫无疑问,这次匹配是没有意义的,应当将 n e x t [ j ]next[j]next[j]的值直接赋值为-1,即遇到这种情况,主串与模式串都从下一位开始比较。

  所以,我们要修正一下 next 数组。

  大致流程和上面求解 next 数组时一样,这里就是多了一个判别条件,如果在匹配时出现了 T n e x t [ j ] = T jT_{next[j]} = T_jTnext[j]=Tj,我们就将 next[j] 更新为 next [\Big[[next[j] ]\Big]] ,直至两者不相等为止(相当于了迭代)。在代码里面实现就是,如果某个字符已经相等或者第一个 next[j] 数组值为-1(即 t = − 1t=-1t=−1),且主串和模式串指针各后移一位时的字符仍然相同,那么就将当前的 next[j] 值更新为上一个 next[j] 数组值,更新后的数组命名为 nextval 。

  代码如下:

def getNextval(substrT):   nextval_list = [-1 for i in range(len(substrT))]   j = 0   t = -1   while j < len(substrT) - 1:     if t == -1 or substrT[j] == substrT[t]:       j += 1       t += 1       if substrT[j] != substrT[t]:         # Tj=Tt, 但T(j+1)!=T(t+1), 这个就和next数组计算时是一样的         # 可以得到nextval[j+1]=t+1         nextval_list[j] = t       else:         # Tj=Tt, 且T(j+1)==T(t+1), 这个就是next数组需要更新的         # nextval[j+1]=上一次的nextval_list[t]         nextval_list[j] = nextval_list[t]     else:       # 匹配失败, 模式串索引为t的字符与当前位进行比较       t = nextval_list[t]   return nextval_list

  对KMP的优化其实就是对 next 数组的优化,修正后的 next 数组,即 nextval 数组如下:

位编号 1 2 3 4 5 索引 0 1 2 3 4 模式串 A A A A B nextval -1 -1 -1 -1 3

  下面就测试一下:

if __name__ == '__main__':   S1 = 'ABACABAB'   T1 = 'ABAB'   S2 = 'AAABAAAAB'   T2 = 'AAAAB'   print('*' * 50)   print('主串S={0}与模式串T={1}进行匹配'.format(S1, T1))   print('{:*^25}'.format('KMP'))   next_list1 = getNext(T1)   print('next数组为: {}'.format(next_list1))   index1_1, count1_1 = KMP(S1, T1, next_list1)   print('匹配到的位置(索引): {}, 匹配次数: {}'.format(index1_1, count1_1))   print('{:*^25}'.format('KMP优化版'))   nextval_list1 = getNextval(T1)   print('nextval数组为: {}'.format(nextval_list1))   index1_2, count1_2 = KMP(S1, T1, nextval_list1)   print('匹配到的位置(索引): {}, 匹配次数: {}'.format(index1_2, count1_2))   print('')   print('*' * 50)   print('主串S={0}与模式串T={1}进行匹配'.format(S2, T2))   print('{:*^25}'.format('KMP'))   next_list2 = getNext(T2)   print('next数组为: {}'.format(next_list2))   index2_1, count2_1 = KMP(S2, T2, next_list2)   print('匹配到的位置(索引): {}, 匹配次数: {}'.format(index2_1, count2_1))   print('{:*^25}'.format('KMP优化版'))   nextval_list2 = getNextval(T2)   print('nextval数组为: {}'.format(nextval_list2))   index2_2, count2_2 = KMP(S2, T2, nextval_list2)   print('匹配到的位置(索引): {}, 匹配次数: {}'.format(index2_2, count2_2))

  运行结果如下:

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